Der Verein Agglo Obersee begann als Modellvorhaben mit vier Gemeinden im Jahr 2003. Der Verkehr des Nadelöhrs «Seedamm» motivierten die Stadt Rapperswil-Jona und die Gemeinden Rüti und Freienbach zur gemeinsamen Zusammenarbeit.
Gründe für die etappenweise Erweiterung auf 20 Mitgliedsgemeinden waren die bereits bisher starke interkommunale Zusammenarbeit, die verstärkte Siedlungsentwicklung in den letzten Dekaden, das Wachstum über die Gemeindegrenzen hinaus und die ähnliche Entwicklungsdynamik aufgrund der S-Bahn und der Autobahnen (A53, A3). Mit der Mitgliedschaft erhofft sich der Gemeinderat unter anderem, für spezielle Projekte Bundesbeiträge erhalten zu können, die ihm bis anhin nicht zugänglich waren.